O programa de Mestrado Acadêmico em Ciências da Saúde da Escola Superior em Ciências da Saúde (ESCS) está registrado na área de medicina I da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES), com entradas anuais de 16 estudantes selecionados por edital púbico. Esse programa de pós-graduação stricto sensu tem proporcionado o desenvolvimento de pesquisas no sentido do fortalecimento do Sistema Único de Saúde (SUS) tanto na atenção quanto no âmbito da qualidade da gestão.
O programa possui como finalidade a formação de pessoal qualificado para o exercício das atividades de ensino, pesquisa e extensão nos campos do conhecimento das Ciências da Saúde.
Apresenta estrutura multidisciplinar conectada com as reais necessidade da população, característica indispensável das profissões de saúde e áreas afins, sendo comumente necessária a interação entre duas ou mais disciplinas, como método de pesquisa e de ensino, promovendo intercâmbio desde a simples comunicação das ideias até a integração mútua de conceitos, da epistemologia, da terminologia, dos procedimentos e das práticas, de modo a explorar a máxima potencialidade, a diversidade e a criatividade de cada ciência.